Emanuel Marcelino nasceu em Lisboa em 1975. Iniciou a sua formação musical no Instituto Gregoriano de Lisboa, que frequentou de 1988 a 1993. Prosseguiu os estudos na Escola Superior de Música de Lisboa, concluindo em 1996 o curso de composição. Em 1999 obteve a licenciatura em música na Universidade de Paris 8. Seguiu seminários de composição orientados por Emmanuel Nunes na Fundação Calouste Gulbenkian, de 1993 a 1998, bem como por outros compositores no estrangeiro, como Franco Donatoni ou Gérard Grisey. Depois de uma breve passagem pelo ensino, dedica-se em exclusivo à composição.